تم استحداث الدراسة العليا / الماجستير في فرع الاحياء المجهرية في عام 2020 بعد اكمال كافة المتطلبات حسب توصيات اللجنة الوزارية المكلفة وتم فتح باب القبول للعام الدراسي 2021-2022 للخريجين من كليات الطب البيطري والكليات العلمية التي تدرس علم الاحياء المجهرية في منهج الدراسات الأولية.
يهدف برنامج الدراسات العليا في علم الأحياء الدقيقة البيطري إلى تخريج باحثين جاهزين لتطبيق الأساليب الحديثة في تشخيص الأمراض المعدية التي تسببها الفيروسات والبكتيريا والفطريات والطفيليات الأخرى , وكذلك سيتمكن هؤلاء الباحثين من ممارسة مهنة في مجال البحث أو في علم الأحياء الدقيقة التشخيصي .